培养目标：生物工程专业基于“知识、能力、素质”全面协调发展的人才培养特色，定位于现代经济发展对于生物技术与工程行业人才的需求，服务于农产品加工、发酵调味品、发酵食品、生物肥料、生物制药等经济产业，培养既掌握了生物学基础知识同时又具备发酵工程学专业技能，毕业后能在生物技术与工程领域从事新产品开发生产、新技术研究和生产管理等工作的应用型高级专门人才。

主要课程：生物化学、微生物学、分子生物学、细胞生物学、化工原理、工程制图、发酵工程、酶工程、细胞工程、分子克隆技术、微生物遗传育种、生物分离工程、发酵工厂设计、发酵分析及检验等。